1月22日 汪精衛(wèi)與日本政府于1939年12月30日簽定的賣國密約被披露。從次日起，《新華日報(bào)》接連發(fā)表社論痛斥賣國投降言論，再次有效助推了重慶各界人士反汪高潮的興起。３月３０日南京偽“國民政府”出籠后，進(jìn)步輿論還針對國民黨頑固派發(fā)動(dòng)的反共逆流，號(hào)召人民起來反對一切公開和暗藏的汪精衛(wèi)，堅(jiān)持抗戰(zhàn)，反對投降；堅(jiān)持團(tuán)結(jié)，反對分裂；堅(jiān)持進(jìn)步，反對倒退。通過反復(fù)掀起的討汪批汪運(yùn)動(dòng)，使得汪精衛(wèi)等漢奸賣國賊聲名狼藉，使得暗藏的投降派有所顧忌。
１月 中共重慶市委重新建立。市委書記由川東特委工運(yùn)部長王致中擔(dān)任，組織部長郭汶、宣傳部長趙利鋒、婦委書記汪敏、委員兼城區(qū)區(qū)委書記甘丹。同年9、10月，王致中、趙利鋒、郭汶先后被調(diào)離，市委改組，由江濤（莫止）接任書記，汪敏接任組織部長，劉傳接任宣傳部長兼江北縣委書記。市委所轄有城區(qū)、新市區(qū)、化龍橋區(qū)（同年6月撤銷，所屬組織劃給新市區(qū)委）、沙磁區(qū)（同年8月劃歸重慶市委領(lǐng)導(dǎo)，在此之前，沙磁區(qū)中心區(qū)委由川東特委直接領(lǐng)導(dǎo)）、江北縣、巴縣。市委建立后，繼續(xù)加強(qiáng)黨員的教育，進(jìn)行鞏固黨的工作，黨的發(fā)展基本停止。
△重屬聯(lián)中發(fā)生反對學(xué)校當(dāng)局開除進(jìn)步學(xué)生的學(xué)潮。在川東特委青委直接領(lǐng)導(dǎo)下，長壽特支和聯(lián)中黨支部采取正確策略，抓住校長貪污公款等劣跡，團(tuán)結(jié)大多數(shù)師生向各界發(fā)出呼吁?！缎氯A日報(bào)》發(fā)表社論表示支持，社會(huì)各方紛紛表示同情和援助。最終迫使教育當(dāng)局接受學(xué)生提出的撤換校長，恢復(fù)被開除學(xué)生學(xué)籍，不追究參加學(xué)潮的師生等要求。學(xué)潮在取得成果后適時(shí)結(jié)束，保護(hù)了黨的組織和學(xué)運(yùn)骨干。
3月8日 在南方局婦委的推動(dòng)下，“全國新生活婦女指導(dǎo)委員會(huì)”在重慶召開“三八”紀(jì)念大會(huì)，１萬余婦女參加。婦女界進(jìn)步人士相繼發(fā)言，一致強(qiáng)烈聲討汪精衛(wèi)，要求團(tuán)結(jié)抗戰(zhàn)，保障女權(quán)。會(huì)后發(fā)起的婦女界反汪簽名運(yùn)動(dòng)。在整個(gè)抗戰(zhàn)期間，婦女界進(jìn)步力量在重慶都比較活躍。
3月14日 國民黨頑固派在成都制造“搶米事件”，陷害共產(chǎn)黨，查封《新華日報(bào)》成都分銷處，逮捕川康特委和分銷處的負(fù)責(zé)人羅世文，抗日群眾領(lǐng)袖、共產(chǎn)黨員車耀先等10余人，成為國民黨頑固派制造系列反共事件的開端。為揭露事實(shí)真相和國民黨頑固派的陰謀，南方局以“中共成都市委”名義起草了“告同胞書”在成渝等地散發(fā)。成都“搶米事件”前后，國民黨特務(wù)在四川各地破壞中共黨組織。隨即，川東地區(qū)先后發(fā)生南充中心縣委、梁大中心縣委以及5縣工委所屬組織遭破壞事件，一些共產(chǎn)黨員被逮捕，環(huán)境日益惡劣。自此后，黨領(lǐng)導(dǎo)的公開群眾運(yùn)動(dòng)基本停止。
5月4日 毛澤東為中共中央起草給南方局的指示信—《放手發(fā)展抗日力量，抵抗反共頑固派的進(jìn)攻》，強(qiáng)調(diào)：黨在國統(tǒng)區(qū)的工作方針應(yīng)是“蔭蔽精干，長期埋伏，積蓄力量，以待時(shí)機(jī)”，反對急性和暴露。對頑固派斗爭的策略應(yīng)是“有理、有利、有節(jié)”，“利用一切可以利用的法律、命令和社會(huì)習(xí)慣所許可的范圍，穩(wěn)扎穩(wěn)打地進(jìn)行斗爭和積蓄力量”。在黨員被迫加入國民黨時(shí)，即加入之；對于地方保甲和一般團(tuán)體應(yīng)廣泛打入之；在國民黨部隊(duì)中應(yīng)廣泛開展交朋友的活動(dòng)。黨的基本方針是發(fā)展進(jìn)步勢力，爭取中間勢力，孤立頑固勢力，用以克服投降危險(xiǎn)，爭取時(shí)局好轉(zhuǎn)。同時(shí)要充分準(zhǔn)備應(yīng)付可能發(fā)生的突然事變。在國統(tǒng)區(qū)黨的機(jī)關(guān)應(yīng)極端秘密，應(yīng)十分注意保護(hù)干部，凡有被捕殺危險(xiǎn)的公開或半公開了的干部應(yīng)轉(zhuǎn)移隱蔽起來。這是抗戰(zhàn)中期以后，中央對國統(tǒng)區(qū)工作方針的一次最全面的指示，成為國統(tǒng)區(qū)工作的指南。
5月 國民黨當(dāng)局捏造鄒韜奮、沙千里、沈鈞儒將鼓動(dòng)軍委會(huì)政治部設(shè)于綦江的戰(zhàn)干團(tuán)學(xué)生舉行暴動(dòng)，派武裝特務(wù)嚴(yán)密監(jiān)視鄒、沙、沈的行動(dòng)和住所。同時(shí)對戰(zhàn)干團(tuán)一些進(jìn)步青年嚴(yán)刑拷問，殺害270人，致傷400余人，制造了“綦江戰(zhàn)干團(tuán)慘案”。
6月 川東特委派張家壁等到涪陵建立涪（陵）、長（壽）、豐（都）、石（柱）、忠（縣）五縣工作委員會(huì)，屬川東特委領(lǐng)導(dǎo)，書記張家壁，組織委員張利生（李思源），宣傳委員沙逸瀛，農(nóng)民委員廖方村。暑假期間，五縣工委在豐都召開第二次會(huì)議，討論黨的鞏固問題。會(huì)議對停止發(fā)展黨員、審查和隱蔽黨員、干部以及加強(qiáng)政治思想、秘密工作、組織紀(jì)律、氣節(jié)教育等問題作了認(rèn)真研究。
7月2日、6日 南方局召開常委會(huì)討論川東黨的工作。廖志高在會(huì)上報(bào)告了半年來川東和重慶的工作。葉劍英、博古、鄧穎超、孔原、劉曉在會(huì)上發(fā)言認(rèn)為，川東是國民黨直接統(tǒng)治地區(qū)的中心地區(qū)，情況特殊，環(huán)境艱苦困難；川東的工作經(jīng)過努力取得了成績，但不能樂觀，川東的黨組織還沒有完全鞏固；今后應(yīng)進(jìn)一步貫徹執(zhí)行中央“蔭蔽精干，長期埋伏，積蓄力量，以待時(shí)機(jī)”的指示，特別是川東黨的工作，就時(shí)局、工作估計(jì)、斗爭策略、群眾工作和統(tǒng)戰(zhàn)工作、組織工作、審查干部、肅清內(nèi)奸、秘密工作方法等問題，以及特委與南方局的聯(lián)系方法問題，作了詳細(xì)的指示。會(huì)議之后，川東特委根據(jù)中央和南方局的指示，在前一段加強(qiáng)鞏固黨的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步貫徹隱蔽方針，在實(shí)踐中逐步形成了一整套工作方法，主要包括：黨的各級(jí)組織之間，上下級(jí)之間實(shí)行單線聯(lián)系，建立平行組織，嚴(yán)禁發(fā)生橫的關(guān)系；實(shí)行精干政策，減少各級(jí)委員會(huì)，必要時(shí)只一人負(fù)責(zé)，不成立委員會(huì)；公開工作與秘密工作機(jī)關(guān)、從事上層活動(dòng)與下層活動(dòng)的干部嚴(yán)格分開；黨員和干部做到職業(yè)化、社會(huì)化、合法化；及時(shí)轉(zhuǎn)移暴露危險(xiǎn)的人員，黨員轉(zhuǎn)移后，實(shí)行轉(zhuǎn)地不轉(zhuǎn)黨；充分利用合法形式，參加到合法團(tuán)體，甚至國民黨黨政機(jī)關(guān)中去，通過廣交朋友的方式開展工作；利用各類社會(huì)關(guān)系作掩護(hù)等等。由于隱蔽方針的貫徹，在國民黨發(fā)動(dòng)的幾次反共高潮中，川東和重慶黨組織未受到嚴(yán)重破壞，主要領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)和骨干力量基本上得到了保存。
8月 由于內(nèi)奸鄒韻宜（時(shí)任觀音橋小學(xué)黨支部書記）的破壞，江北縣委委員向德侖被中統(tǒng)特務(wù)逮捕。以后又?jǐn)?shù)次發(fā)生江北縣黨組織被破壞、黨員被捕的事件，并牽連到重慶市內(nèi)。川東特委、重慶市委緊急疏散了三任縣委書記，并派人清查內(nèi)奸。到1941年春，鄒韻宜的面目暴露。
8月至9月 根據(jù)南方局決定，孔原在巴縣木洞鎮(zhèn)建立中共西南工作委員會(huì)。西南工委以孔原為書記，錢瑛、廖志高、于江震、蔡書彬等先后為委員，負(fù)責(zé)領(lǐng)導(dǎo)川東特委、川康特委、貴州省臨工委、云南省工委、湘鄂西區(qū)黨委的工作。同年冬，孔原在木洞被國民黨特務(wù)發(fā)現(xiàn)，南方局獲悉后立即通知孔原返回八路軍辦事處?！巴钅鲜伦儭焙?，南方局派錢瑛為西南工委書記，去成都組織機(jī)關(guān)。這年冬，因環(huán)境惡劣，錢瑛撤回重慶。1942年春，西南工委撤銷。
10月 川東特委決定成立巴縣中心縣委。書記賴紹堯（何作柱），組織部長羅浩，宣傳部長嚴(yán)慕蘇。中心縣委轄巴縣、綦江、南川、長壽、永川、榮昌、隆昌、江津和黔北部分地區(qū)的黨組織，以及重慶市內(nèi)部分黨組織。巴縣中心縣委機(jī)關(guān)常駐重慶，與重慶市委平行開展工作。1942年5月以后，巴縣中心縣委成員只有蕭澤寬、李治平兩人，一直堅(jiān)持到抗戰(zhàn)勝利結(jié)束時(shí)，中心縣委保持了完整的組織系統(tǒng)。
